Odpadł z rozgrywek w 1/32 finału, przegrywając 2:3 ze Stalą Ib Poznań na własnym boisku.
Najlepsze drużyny województwa opolskiego zostały podzielone na 8 grup, w których rywalizowały o mistrzostwo I klasy wojewódzkiej. Wiosną 1952 Włókniarz Prudnik wygrał rozgrywki w IV grupie, dzięki czemu wszedł do finałów mistrzostwa okręgu OZPN Opole. W ćwierćfinale klub zwyciężył przeciwko Unii Kędzierzyn, w półfinale pokonał Gwardię Opole, a w finale Ogniwo Nysa. Włókniarz zdobył tytuł mistrza Opolszczyzny i miał przystąpić do rozgrywek II ligi w przyszłym sezonie, jednak w związku z reorganizacją II ligi klub ostatecznie znalazł się w III lidze makroregionalnej, w której pierwszy sezon zakończył na 10. miejscu w tabeli.
W meczu towarzyskim we wrześniu 1954 Włókniarz pokonał II-ligowy klub Baník Vítkovice z Czechosłowacji 3:1. Sezon 1954 Włókniarz Prudnik zakończył na czwartym miejscu w tabeli III ligi wrocławsko-opolskiej, a sezon 1955 na dziewiątym. W kwietniu 1956 przywrócono starą nazwę klubu – Pogoń Prudnik. Największym sukcesem klubu w sezonie 1956 było zwycięstwo 2:0 w meczu przeciwko Śląskowi Wrocław, który był liderem grupy. Pogoń zakończyła sezon na 11. miejscu w tabeli.