Przybył tam 19 września, po czym 20 września wraz z zespołem innych okrętów odpłynął w kierunku Kanału Królewskiego z zamiarem przejścia do Brześcia (według wspomnień dowódcy: „wykorzystując małe zanurzenie postanawiam iść do Pińska i dalej, na Kanał Królewski, by nie kończyć wojny bez strzału”)Jerzy Pertek: Wielkie dni małej floty, Wyd. Poznańskie, Poznań 1976, s. 194-195.. Z powodu jednak zatarasowania nurtu przez wysadzony przez saperów most kolejowy na linii wąskotorowej Janów Poleski – Kamień Koszyrski, 21 września ORP „Kraków” został samozatopiony przez załogę koło Kuźliczyna. Nie zdecydowano wysadzić monitora w powietrze z uwagi na bliskość okolicznych wsi. Podczas kampanii wrześniowej nie brał bezpośrednio udziału w działaniach bojowych.

Służba w ZSRR Po zakończeniu walk, okręt został jeszcze we wrześniu podniesiony przez Rosjan, po czym w 1940 roku wyremontowany i przezbrojony w dwie haubice kalibru 122 mm w wieży dziobowej, dwa działka uniwersalne kalibru 45 mm w nowej wieży rufowej oraz radzieckie karabiny maszynowe kalibru 7,62 mm. Pod nazwą „Smoleńsk” został 24 października 1939 roku wciągnięty oficjalnie w skład radzieckiej Flotylli Dnieprzańskiej, od 17 lipca 1940 roku – radzieckiej Flotylli Pińskiej. Wchodził w skład 2.