W latach 1918–1933 powstało wiele rodzimych Kościołów o charakterze zielonoświątkowym, takich jak: Chrystusowy Kościół Apostolski, Kościół Cherubów i Serafinów, Kościół Pana „Aladura”. Kościoły te zostały założone przez plemię Joruba z południowo-zachodniej Nigerii. W Kościołach tych praktykuje się uzdrowienia przez wiarę, wizje, głośne modlitwy, klaskanie, mówienie językami i zwiedzanie świętych miejsc wprowadzone z afrykańskich religii tradycyjnych.
W 1939 roku misję rozpoczęła zielonoświątkowa denominacja Zbory Boże. W 2016 roku Zbory Boże w Nigerii liczyły 3,1 mln wiernych, w blisko 12 tys. zborach.
Tysiące osób w północnej i środkowej Nigerii zginęło w ostatnich latach w wyniku prześladowań chrześcijan ze strony społeczności muzułmańskiejPrześladowania chrześcijan..
Statystyki Dane statystyczne według książki Patricka Johnstona i Jasona Mandryka pt.