Po złożeniu 4 listopada 1951 oficjalnej wizyty w Kanadzie razem z żoną został powołany przez króla Jerzego VI do Tajnej Rady Wielkiej Brytanii. W styczniu 1952 rozpoczął z żoną objazd po krajach Wspólnoty Narodów, który przerwali 6 lutego 1952 podczas pobytu w Kenii w związku ze śmiercią ojca Elżbiety. To Filip przekazał informację o śmierci króla żonie, po czym oboje niezwłocznie powrócili do Wielkiej Brytanii, a Elżbieta została nową królową Zjednoczonego Królestwa. Śmierć teścia załamała Filipa, ponieważ zdał sobie sprawę z faktu, że po objęciu tronu przez żonę jego pozycja jako głowy rodziny będzie drugorzędna wobec obowiązku Elżbiety wobec korony.
Mąż królowej mały|Elżbieta II i Filip (1953) Wstąpienie Elżbiety II na tron wywołało zamieszanie w kwestii nazwiska, jakie nosić będą dzieci jej i Filipa. Książę i jego wuj, Louis Mountbatten, nalegali, by dzieci nosiły nazwisko ojca (Mountbatten). Królowa Maria poinformowała o ich zamiarach premiera Winstona Churchilla, który zalecił Elżbiecie II wydanie królewskiej odezwy stwierdzającej, że rodzina królewska pozostaje przy rodowym nazwisku – Windsor. Filip prywatnie skarżył się, że czuje się w rodzinie jak „ameba” i jest jedynym człowiekiem w kraju, który nie może dać dzieciom swojego nazwiska. Miał z żoną czwórkę dzieci: Karola (ur. 1948), Annę (ur. 1950), Andrzeja (ur.