Po zakończeniu kariery Egea ukończył kurs trenerski i jako na początku pracy w roli szkoleniowca współpracował głównie z młodzieżą, z sukcesami prowadząc kluby Villena i Pinoso. W 1995 roku został ściągnięty przez swojego rodaka Jorge Valdano do Realu Madryt, gdzie objął drugoligowy zespół rezerw – Real Madryt Castilla. Współpracując tam z takimi piłkarzami jak Guti czy Esteban Cambiasso, w sezonie 1995/1996 zajął z nim wysokie, czwartą lokatę w Segunda División, jednak stracił pracę w trakcie kolejnych rozgrywek, 1996/1997, w których Castilla zajęła miejsce w strefie spadkowej i została relegowana do trzeciej ligi. W sezonie 1997/1998 prowadził CD Toledo, również z drugiej ligi hiszpańskiej, gdzie mimo kłopotów finansowych w klubie zdołał utrzymać go na zapleczu najwyższej klasy rozgrywkowej. W 1998 roku podpisał kontrakt z innym klubem z Segunda División, Hércules CF, którego barwy reprezentował już jako piłkarz. Został jednak zwolniony z powodu słabych wyników po ośmiu kolejkach, a drużyna na koniec sezonu 1998/1999 spadła do trzeciej ligi. W rozgrywkach 1999/2000 bez większych sukcesów prowadził czwartoligowe rezerwy Realu Valladolid.