W 2001 roku Egea został członkiem sztabu szkoleniowego meksykańskiego trenera Hugo Sáncheza, z którym współpracował w roli asystenta przez kolejne osiem lat. Początkowo towarzyszył mu w stołecznym Pumas UNAM, z którym zdobył dwa mistrzostwa Meksyku w sezonach Clausura 2004 i Apertura 2004, a także superpuchar kraju – Campeón de Campeones – w tym samym roku. Później pomagał Sánchezowi również w Club Necaxa, a także reprezentacji Meksyku, z którą w 2007 roku dotarł do finału Złotego Pucharu CONCACAF oraz zajął trzecie miejsce w Copa América. Ostatnim ich wspólnym przystankiem trenerskim był hiszpański pierwszoligowiec UD Almería.
W maju 2012 Egea został trenerem klubu Altamira FC z drugiej ligi meksykańskiej. Został zwolniony w marcu 2013 po serii słabych wyników; w 34 meczach odniósł osiem zwycięstw, dziewięć remisów i siedemnaście porażek. Trzy miesiące później rozpoczął pracę w roli asystenta Joaquína del Olmo w drużynie Correcaminos UAT z miasta Ciudad Victoria, również występującej na zapleczu pierwszej ligi w Meksyku.