Został pochowany na tamtejszym cmentarzu Ixelles.
Upamiętnienie thumb|240px|Ławeczka z tabliczką upamiętniającą Mariana Pankowskiego na Rynku w Sanoku thumb|240px|Dąb szypułkowy „Marian” przy gmachu dawnego gimnazjum w Sanoku thumb|240px|Tablica honorująca Pankowskiego w Sanoku Sanocki poeta Janusz Szuber napisał wiersz pt. Pankowski, wydany w tomikach poezji pt. Paradne ubranko i inne wiersze z 1995, pt. Tam, gdzie niedźwiedzie piwo warzą z 2004 oraz pt. Pianie kogutów z 2008. Sanoczanka Barbara Bandurka napisała utwór Dla Mariana Pankowskiego, opublikowany w jej tomiku poezji pt. Zieleń Veronese’a z 2005.
W Sanoku na Rynku przed kamienicą przy ul. Rynek 14 została ustanowiona ławeczka pamięci Mariana Pankowskiego, odsłonięta 9 listopada 2011 w 90. rocznicę urodzin pisarza przez jego bratową Jadwigę z tabliczką zawierającą cytat z Pankowskiego: „To tu, pamiętasz? ...Trwał twój świat”. Naprzeciwko powstała analogiczna ławeczka poświęcona jego szkolnemu koledze, Kalmanowi Segalowi.