W 1900 biskup tobolski Antoni sfinansował srebrną rakę, do której następnie przeniesiono relikwie metropolity.
Kanonizacja mały|200px|Kanonizacja Jana (Maksymowicza), Tobolsk, 1916 W 1913 duchowieństwo eparchii tobolskiej wystosowało do jej ordynariusza, biskupa Barnaby, prośbę o kanonizację Jana (Maksymowicza). Analogiczną prośbę otrzymał car Mikołaj II. Przygotowania do kanonizacji podjęte zostały jednak dopiero dwa lata później. Zaliczenie hierarchy w poczet świętych gorąco poparł car, który wierzył, że to wstawiennictwo Jana było przyczyną sukcesów militarnych wojsk rosyjskich. W 1915 biskup tobolski Barnaba sam przeprowadził ceremonię kanonizacji. Została ona anulowana przez Świątobliwy Synod Rządzący, jednak z uwagi na zebranie w toku przygotowań do kanonizacji wielu świadectw cudów za pośrednictwem metropolity zdecydowano o jej powtórzeniu. W roku następnym w Tobolsku ceremonia została przeprowadzona po raz drugi, tym razem z zachowaniem wszelkich procedur.