Dwudniowa wyprawa zakończyła się lądowaniem astronautów w bazie lotniczej Edwards w Kalifornii.
Swój szósty i ostatni lot odbył w okresie od 28 listopada do 8 grudnia 1983. Ponownie dowodził promem Columbia. Misja nosiła oznaczenie STS-9. W skład załogi wchodził pierwszy astronauta z RFN – Ulf Merbold, który był zarazem pierwszym cudzoziemcem na amerykańskim wahadłowcu. Pilotem misji był Brewster Shaw, specjalistami misji i ładunku – Owen Garriott, Robert A. Parker i Byron Lichtenberg. Young pobił swój rekord uczestnictwa w lotach załogowych, zostając pierwszym astronautą, który sześć razy był kosmosie. Lot STS-9 miał charakter naukowy. W laboratorium Spacelab, które znajdowało się w ładowni Columbii, astronauci na dwie zmiany prowadzili eksperymenty naukowe przez 24 godziny na dobę.
W czasie swoich 6 lotów przebywał poza Ziemią łącznie przez ponad 34 dni.
W sierpniu 1986 Young miał szansę na swój siódmy lot w kosmos, ponieważ miał dowodzić wyprawą STS-61-J, której zadaniem było wyniesienie na orbitę teleskopu Hubble’a. Katastrofa promu Challenger jednak wstrzymała realizację planów i lot został anulowany.