Przed 1962 przemianowane na AC-47D. NC-47D Wersja C-47D przystosowana do roli samolotu testowego. RC-47D Wersja C-47D wyposażona w urządzenia rozpoznania fotograficznego. SC-47D Wersja C-47D przystosowana do zadań lotniczego pogotowia ratunkowego. W 1962 przemianowana na HC-47D. VC-47D Wersja C-47D przystosowana do przewozu VIP-ów. C-47E Zmodyfikowana wersja transportowa z możliwością przewozu 27–28 pasażerów lub ładunku. C-47F Zmodyfikowana wersja cywilnego Super DC-3 przystosowana do potrzeb USAF. Przemianowany na YC-129. Później zostały przekazane do US Navy jako XR4D-8. C-47H/J/L/M Wersje przystosowane do udzielania wsparcia misjom attaché marynarki wojennej itp. EC-47N/P/Q Wersje samolotów C-47A i C-47D przystosowane do pełnienia misji różnorodnych misji specjalnych.