Zmarł 5 lutego 1705 w Berlinie. Nabożeństwo pogrzebowe odbyło się w kościele kościele św. MikołajaHorst Ulrich, Uwe Prell, Ernst Luuk: Nikolaikirche. In: Berlin Handbuch. Das Lexikon der Bundeshauptstadt. FAB-Verlag, Berlin 1992, , S. 887..

Pia desideria Główne dzieło Spenera „Pia desideria oder herzliches Verlangen nach gottgefälliger Besserung der wahren Evangelischen Kirche samt einigen dahin einfältig abzweckenden christlichen Vorschlägen” (pl. „Pia desideria – Pobożne pragnienia, czyli szczere pragnienie reformy prawdziwego Kościoła ewangelickiego zgodnej z wolą Boga”) ukazało się 24 marca 1675 jako przedmowa do nowego wydania postylli Jana Arndta.

Reakcja na ten wstęp była tak powszechna, że Spener postanowił opublikować go jako osobne wydanie, które ukazało się 8 września 1675 r. i zostało rozszerzone o przedmowę oraz dwie recenzje. Dzieło to opiera się podobno na pismach mistycznych duchowych, takich jak „Spiegel der Missbräuche beim Predigtamt” Christiana Hoberga. Pogląd ten jest jednak kwestionowany.