Najprawdopodobniej jednak od lipca 1918 do sierpnia 1919, gdy Jekaterynburg zajęty był przez wojska Białych, cerkwi przywrócono jej dawną rolę. Służyć ona miała 25 Pułkowi Piechoty armii admirała Aleksandra Kołczaka.
Czasy sowieckie Zmiany dla funkcjonowania obiektu i regularnego kultu religijnego przyniosło ostatecznie zwycięstwo bolszewików. Już w 1919 świątynia przekształcona została w cerkiew parafialną. W 1922 w czasie akcji konfiskaty majątku Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego ogołocono ją z 19 funtów srebra, tj. 7,7 kilogramów. W latach dwudziestych XX wieku, w konflikcie jaki wstrząsnął Rosyjskim Kościołem Prawosławnym, duchowieństwo jekaterynburskiej cerkwi Podwyższenia Krzyża Pańskiego poparło ruch odnowicielstwa. W 1924, jako jedni z nielicznych w mieście uczynili to z własnej woli, w innych przypadkach bolszewicy wspierali przejmowanie obiektów sakralnych przez odnowicielstwo. Zachowały się informacje na temat niektórych duchownych świątyni. W 1923 posługiwał tam protojerej S. Koniew, a w 1925 protojerej A. Mieledin. W 1927 duchowieństwo świątyni zmieniło swe ukierunkowanie, porzucając Żywą Cerkiew i uznając przywództwo metropolity Sergiusza, sprawującego wówczas funkcję strażnika nieobsadzonego tronu patriarszego.