Od zwycięstwa komunistów w chińskiej wojnie domowej w 1949 diecezja, podobnie jak cały prześladowany Kościół katolicki w Chinach, nie może normalnie działać. W grudniu 1952 nowe władze wydaliły z kraju biskupa Shantou Charlesa Vogela MEPmepasie.org.
W latach 1981–1997 diecezją rządził mianowany przez Patriotyczne Stowarzyszenie Katolików Chińskich antybiskup.
W 2006 na biskupa Shantou wyświęcony został Peter Zhuang Jianjian. Miał on zgodę papieską lecz na przyjęcie święceń biskupich nie wyraził zgody rząd ChRL. Obecnie bp Zhuang Jianjian mieszka w jednej z wiejskich parafii służąc oficjalnie jako prezbiter (rząd pekiński nigdy nie uznał jego sakry). W 2011 bez mandatu papieskiego wyświęcony został koncesjonowany antybiskup Shantou Joseph Huang Bingzhang, który tym samym zaciągnął na siebie ekskomunikę. Księża z diecezji Shantou oraz biskupi z sąsiednich diecezji, którzy nie chcieli wziąć udziału w nielegalnej (z kościelnego punktu widzenia) sakrze, zostali przymuszeni przez państwowych urzędników do udziału w uroczystościachUcaNewsCatholic Herald.
Ordynariusze Wikariusze apostolscy Adolphe Rayssac MEPFrancuz (1914 – 1935) Charles Vogel MEP (1935 – 1946)