Od 1994 do 1998 roku członek ZSP UW – Marek Wikiński, był przewodniczącym Rady Naczelnej Zrzeszenia Studentów Polskich, dzięki temu udawało się bronić (na tyle, na ile było to możliwe) interesów ZSP na Uniwersytecie Warszawskim. Rada Uczelniana Zrzeszenia Studentów Polskich znalazła na cztery lata swoją siedzibę w prowizorycznym kiosku ustawionym na terenie kampusu głównego w okolicy Szkoły Języków Obcych. 10 marca 2000 roku Zrzeszenie Studentów Polskich uzyskało prawo do użytkowania pomieszczenia przy ul. Nowy Świat 69 p. 36 (Pałac Zamoyskich) w którym ma swoją siedzibę do dziś, natomiast prowizoryczny kiosk został rozebrany 17 marca 2000 roku. W pierwszych latach XXI wieku działalność ZSP UW rozwijała się bardzo dynamicznie, Rada Uczelniana słynęła z organizacji obozów wyjazdowych i realizowania projektów ogólnokrajowych ZSP.
W latach 2006–2011 ZSP UW borykało się z dużymi problemami kadrowymi, kwestia sporna leżała w utrzymaniu siedziby i dyscyplinie członków, Zrzeszenie zostało wchłonięte przez Radę Okręgową ZSP w Warszawie i prowadziło bierną działalność na Uniwersytecie Warszawskim. W 2011 roku grupa studentów reaktywowała ZSP UW na Uniwersytecie Warszawskim, jego pierwszym przewodniczącym po przerwie został Marcin Budzyński.