W III RP Konfederacja Polski Niepodległej przyjęła Międzymorze za oficjalną koncepcję geopolityczną, co potwierdził IV Kongres KPN (Warszawa 1992). KPN współtworzyła Ligę Partii Krajów Międzymorza, powołaną w Kijowie w lipcu 1994 r. i grupującą partie niepodległościowe z Białorusi, Estonii, Litwy, Łotwy, Polski i UkrainyTenże, „II Kongres Ligi Partii Krajów Międzymorza” w: „Gazeta Polska KPN” 225-226, 25 VI – 8 VII 1995.. Jej trzy kongresy odbyły się w latach 1995–1997, a zamarła pod koniec lat 90. wskutek przemian politycznych w regionie i marginalizacji jej animatorówTenże, Międzymorze – zapomniana idea niezależności narodowej i stabilizacji regionalnej, „Magazyn Obywatel” 3 (29), 2006..
Do idei tej nawiązywały niektóre niepolityczne inicjatywy społeczne, podejmujące problematykę Europy Środkowej – jak utworzone przez osoby związane m.in. z Solidarnością Walczącą i Liberalno Demokratyczną Partią „Niepodległość” Fundacja Wschodnia „Wiedza” (1990 r. – Piotr Hlebowicz, Piotr Pacholski) czy nastawiony na współpracę w szczególności z Tatarami Krymskimi i Kazańskimi Instytut im. Gen. Macieja Sulkiewicza (1991 r.). Do tej kategorii należało też istniejące od 1988 r. „Towarzystwo Pomost”T00453 Towarzystwo Pomost Warszawa – Encyklopedia Solidarności., które na początku lat 90.