Po rozformowaniu Lubuskiej Brygady WOP, 1 listopada 1989 strażnica została włączona w struktury Pomorskiej Brygady WOP w Szczecinie i tak funkcjonowała do 15 maja 1991.
Straż Graniczna: Po rozwiązaniu Wojsk Ochrony Pogranicza, 16 maja 1991 strażnica w Słubicach weszła w podporządkowanie Lubuskiego Oddziału Straży Granicznej i przyjęła nazwę Strażnica Straży Granicznej w Słubicach (Strażnica SG w Słubicach).
Ochrona granicy W 1956 Graniczna Placówka Kontrolna Słubice została zlikwidowana, a przejście graniczne Słubice-Frankfurt podporządkowane zostało GPK Kunowice. W 1957 przejście graniczne ze Słubic zostało przesunięte na nowo otwarty most w Świecku. Most w Słubicach został oddany pod ochronę strażnicy WOP Słubice.
W 1960 5 strażnica WOP Słubice II kategorii ochraniała odcinek granicy państwowej o długości 9400 m: Od znaku granicznego nr 480 do znaku. gran. nr 497.
Rozkazem organizacyjnym dowódcy WOP nr 0148 z 2.09.1963 rozformowano strażnicę WOP Nowy Lubusz, a jej odcinek przekazano pod ochronę strażnicom WOP: Słubice i Pławidło.