Etat przewidywał także instruktora do tresury psów służbowych oraz instruktora sanitarnego.
Rozkazem organizacyjnym szefa Departamentu WOP nr 013 z 21.03.1947 roku Strażnica WOP nr 51 Kostrzyn z 3 Szczecińskiego Oddziału WOP została przekazana do Komendy odcinka nr 10 Górzyca z 2 Poznańskiego Oddziału WOP.
W związku z reorganizacją oddziałów WOP, 24 kwietnia 1948 roku 51 strażnica OP Kostrzyn została włączona w struktury 36 batalionu Ochrony Pogranicza w Słońsku, a 1 stycznia 1951 w struktury 94 batalionu WOP w Słońsku.
Od 15 marca 1954 wprowadzono nową numerację strażnic, a strażnica WOP Kostrzyn I kategorii otrzymała nr 49 w skali kraju. W 1956 roku rozpoczęto numerowanie strażnic na poziomie brygady. Strażnica specjalna WOP Kostrzyn była 21. w 9 Brygadzie Wojsk Ochrony Pogranicza. W tym samym roku rozwiązano 94 batalion WOP, a jego strażnice zostały włączone w struktury 93 batalionu WOP w Słubicach.