23 grudnia 1999 w wyniku reorganizacji, strażnica została włączona w struktury Pomorskiego Oddziału SG (POSG) w Szczecinie.

W 2000 rozpoczęła się reorganizacja struktur Straży Granicznej, związana z przygotowaniem Polski do wstąpienia, do Unii Europejskiej i przystąpieniem do Traktatu z Schengen. W wyniku tej restrukturyzacji 1 października 2002 Strażnica SG w Namyślinie została rozformowana. Jej obszar służbowej odpowiedzialności przejęła Strażnica SG w Czelinie.

Ochrona granicy thumb|Żołnierze WOP na łodzi motorowej patrolujący Odrę (1969) W 1960 29 strażnica WOP III kategorii ochraniała odcinek granicy państwowej o długości 11750 m: Od znaku granicznego nr 560, do znaku gran. nr 585.

Do patrolowania rzeki Odry załoga strażnicy wykorzystywała łodzie motorowe KR-70, których przystań znajdowała się w Kaleńsku.

Wydarzenia 1968 – Stocznia Marynarki Wojennej przekazała dla WOP pierwszą partię kutrów rozpoznawczych, które skierowano do służby rzecznej na odrzańskim odcinku granicy zachodniej Pomorskiej Brygady WOP (W latach następnych zaopatrzono w nie pozostałe strażnice rzeczne). 1976 – wycofano z granicy rowery, zastępując je motocyklami małolitrażowymi;