Okres dojrzałości W 1607 roku Takuan został opatem klasztoru Nansō. W marcu 1608 roku został wyznaczony przez cesarza Go-Yōzeia (後陽成, pan. 1586-1611) opatem prestiżowego klasztoru Daitoku. Jednak już po trzech dniach w Daitoku-ji opuścił go i udał się do Nansō-ji. Tak to skomentował: "Buddyzm z MurasakinoSynonim Daitoku-ji jest dziś bezużyteczny"Nobuko Hirose. Immovable Wisdom. Str. 7. Mimo opuszczenia Daitoku-ji, troszczył się o niego, np. odnowił Daisen-in wraz z ogrodem, który jest obecnie jednym z najbardziej znanych ogrodów w Japonii. Takuan odnawiał wiele klasztorów i świątyń, był bowiem przeciwnikiem modnego wówczas nastawienia, aby pozostawiać stare kompleksy bez opieki, a na ich gruzach budować nowe obiekty.
W latach 1614–1615 trwała w Japonii wojna o zamek w Osace, która spowodowała zniszczenie zarówno Nansō-ji jak i Sugyō-ji w Tajimie. Po zakończeniu walk Takuan odbudował w ciągu trzech lat oba klasztory przy pomocy lokalnego Pana - Koide Yoshihide (1586–1668), który faworyzował go i uczynił opatem odbudowanego klasztoru SugyōTakuan nie mieszał się do polityki. Odmówił zarówno zaproszeniu na zamek w Osace, jak i cesarzowi. Mimo obowiązków Takuan wędrował po Japonii zatrzymując się w małych wiejskich świątyniachNobuko Hirose. Immovable Wisdom. Str. 8Heinrich Dumoulin. Zen Buddhism: a History. Japan. Str.