Wyróżnienia i upamiętnienie Jeffrey Harborne otrzymał: 1985 – Złoty Medal Towarzystwa Linneuszowskiego w Londynie, 1986 – Srebrny Medal Phytochemical Society of Europe, 1993 – Srebrny Medal International Society of Chemical Ecology, 1993 – Pergamon Phytochemistry Prize for Creativity in Plant Biochemistry. Został członkiem Royal Society (FRS) w roku 1995.
Wyrazem uznania dla jego dorobku jest również publikacja Contributions of Jeffrey Harborne and co-workers to the study of anthocyanins, która ukazała się w Phytochemistry w roku 2001. W roku 2003 wydano specjalny numer czasopisma – Special issue in memory of Professor Jeffrey Barry Harborne, FRS (1928–2002).
Życie osobiste Jeffrey Harborne był człowiekiem o rozległych zainteresowaniach – zamiłowanym czytelnikiem m.in. biografii i książek z dziedziny muzyki i sztuki; chętnie odwiedzał galerie sztuki, fotografował, grał na klarnecie. Był silnie związany z tradycją anglikańską (odgrywał ważną rolę w Christ Church Reading).