7 sierpnia 2016 roku strzelił bramkę w przegranym 2–1 meczu z Manchesterem United w pucharowym meczu Tarczy Wspólnoty. Dwadzieścia dni później zdobył swoją pierwszą bramkę w lidze w pierwszym zwycięstwie Leicester 2–1 nad Swansea City.
10 grudnia Vardy zakończył swoją dziesięciomeczową niemoc strzelecką już w pierwszych pięciu minutach meczu z Manchesterem City. Ostatecznie zdobył jeszcze dwie bramki, zapewniając sobie tym samym pierwszy zawodowy hat-trick i przyczyniając się do zwycięstwa Leicester 4–2, ich pierwszego sukcesu w pięciu ostatnich meczach ligowych.
Tydzień później został ukarany czerwoną kartką w pierwszej połowie, w zremisowanym 2–2 spotkaniu z Stoke City za faul na Mame Biramie DioufieJamie Vardy to serve three-match ban after red card appeal is rejected - The Guardian.
22 lutego 2017 roku Vardy zdobył swoją pierwszą bramkę w Lidze Mistrzów w przegranym 2–1 wyjazdowym meczu z Sevillą w pierwszym meczu rundy szesnastejJamie Vardy hands Leicester Champions League lifeline against Sevilla - The Guardian.