Samwel Melkonian (orm. Սամվել Մելքոնյան, ur. 15 marca 1984 w Erywaniu) – ormiański piłkarz grający na pozycji prawego pomocnika. Od 2013 jest zawodnikiem klubu Gandzasar Kapan.
Kariera klubowa Swoją karierę piłkarską Melkonian rozpoczął w klubie Bananc Erywań. W 2002 roku awansował do kadry pierwszego zespołu i wtedy też zadebiutował w nim w rozgrywkach pierwszej ligi ormiańskiej. W zespole Bananca występował do 2007 roku. Zdobył z nim Puchar Armenii w 2007 oraz wywalczył trzy wicemistrzostwa tego kraju w latach 2003, 2006 i 2007.
W 2008 roku Melkonian przeszedł do ukraińskiego Metałurha Donieck. Grał w nim przez rok, po czym w 2009 roku wrócił do Bananca Erywań. W 2010 roku został z nim wicemistrzem kraju.
W 2011 roku Melkonian przeszedł do Miki Erywań. Swój debiut w Mice zaliczył 5 marca 2011 w zremisowanym 1:1 wyjazdowym meczu z Araratem Erywań. W Mice grał przez rok.
W styczniu 2012 roku Melkonian podpisał kontrakt z Czernomorcem Burgas. Debiut w Czernomorcu zanotował 4 marca 2012 w zwycięskim 2:0 domowym meczu z CSKA Sofia. W Bułgarii spędził pół sezonu.
Latem 2012 Melkonian wrócił do Armenii i został zawodnikiem klubu Ulis Erywań. Zadebiutował w nim 10 sierpnia 2012 w przegranym 1:2 domowym meczu z Miką Erywań.