Po powrocie do Cesarstwa Rosyjskiego krótko ponownie pracował u Reimersa, a w latach 1902–1912 praktykował prywatnie w Tallinnie, z przerwą na służbę w armii rosyjskiej podczas wojny rosyjsko-japońskiej. W 1912 otworzył własną klinikę okulistyczną"Would you mind if I wrote to you in Estonian?" Friedrich Akel's Letters to his Future Wife Adele Tenz from the Years 1903-1905.. W latach 1913–1917 był przewodniczącym tallińskiej Rady MiejskiejTallinnas avati Friedrich Karl Akeli mälestustahvel.. Otrzymał również godność honorowego sędziego pokoju. Zasiadał w zarządach Północno-Bałtyckiego Zrzeszenia Lekarzy oraz Tallińskiego Towarzystwa Oświaty Ludowej. Był także szefem rady nadzorczej Tallińskiego Towarzystwa Pożyczkowo-Oszczędnościowego – prekursora Tallińskiego Banku Kredytowego, zaś w latach 1920–1922 – wiceprzewodniczącym konsystorza Estońskiego Kościoła Ewangelicko-LuterańskiegoFriedrich Karl Akel..
Od 1907 do 1908 prezesował klubowi sportowemu Kalev, który w tym okresie rozszerzył swoją działalność z kolarstwa i łyżwiarstwa na tenis ziemnyAjalugu..