W czasie wojny Elliot bezpośrednio kierował brytyjskimi działaniami w delcie Rzeki Perłowej z pokładu „Nemesis”.
thumb|left|Dom Elliota w Makau
Na podstawie uzgodnionej 20 stycznia 1841 roku między Elliotem i Qishanem (generalnym gubernatorem Guangxi i Guangdongu), ale nigdy nie ratyfikowanej Konwencji z Chuenpi, na polecenie Elliota, komodor sir George Brennan przejął wyspę Hongkong w posiadanie brytyjskie 26 stycznia. 2 lutego Elliot proklamował przejęcie Hongkongu jako kolonii korony i objęcie rządów nad nią (tj. de facto, jeśli nie de iure stanowiska gubernatora) przez Superintendenta Handlu w imieniu Jej Królewskiej Mości; wszyscy Brytyjczycy mieli podlegać prawu brytyjskiemu, Chińczycy – chińskiemu (z wyjątkiem stosowania tortur). Ze względu na brak uznania Konwencji z Chuenpi przez obydwa rządy, proklamacja Elliota i wynikające z niej działania były prawnie wątpliwie, niemniej jej postanowienia zostały zatwierdzone przez podpisany w 1841 roku traktat nankiński.