Współczesność 240px|right|thumb|Teren nowego ogrodu botanicznego W 1999 rozpoczęto proces reorganizacji ogrodu, który ma doprowadzić do uporządkowania poszczególnych kolekcji i wyeksponowania roślin zgodnie z obowiązującymi kryteriami fitogeograficznymi i systematycznymi, rozbudowano dział systematyki roślin i roślin leczniczych. Podjęto próbę odtworzenia karpatarium (roślinność subalpejska charakterystyczna dla Karpat), powiększono akwen stawu co umożliwiło rozwój kolekcji roślin wodnych i błotnych w zbiorniku i wzdłuż strumienia. Rozpoczęto wieloletni proces odtworzenia kolekcji róż, chryzantem i dalii, odnowiono kolekcję paproci gruntowych oraz zrekonstruowano dział roślin uprawnych, jednorocznych i wieloletnich. Powstała nowa kolekcja mieczyków, storczyków, mięsożernych a kolekcja roślin imbirowatych uległa znacznej rozbudowie.
Uprawianych jest 3350 taksonów roślin, z czego ok. 1200 to rośliny tropikalne i subtropikalne.
Obecnie ogród składa się z pięciu głównych sekcji: rośliny zielne dziko rosnące tj.