Prędkość sondy względem Itokawy wynosiła 0,25 mm/s 15 września – wykonano pierwsze zdjęcia w szerokim spektrum barw (na stronie badacze umieścili wersję w odcieniach szarości)The synthesized pseudo-color image of Itokawa which took by Hayabusa. Odległość do planetoidy wynosiła 17 km 19-21 września – odległość do planetoidy zmalała do 15 km, po czym zwiększono ją do 19,5 km 22 września – kontrolerzy lotu sondy zaproponowali nazwy trzech regionów powierzchni Itokawy: Woomera Desert, Uchinoura Bay, Muses Sea 26 września – dystans do planetoidy zmniejszono do 16 km 29 września – Hayabusa dotarła na odległość 10 km od planetoidy Itokawa 30 września – dystans między sondą a Itokawą zmniejszono do 6,8 km, ale jednocześnie odpalono silniki (dV = 0,05 m/s), aby oddalić sondę 3 października, godz. 08:08 – awarii uległo drugie koło zamachowe (oś Y).