kiedy 12 kwietnia 1654 kościół wizytował biskup Miguel Juan Balaguer Camarasa, opiekunem był Giovanni Maria Portelli z Ħal Bisbut.

Z biegiem czasu budynek popadł w coraz większe zaniedbanie, w końcu 22 kwietnia 1659 biskup Balaguer zdesakralizował go. Zarządził zamurowanie drzwi oraz przeniesienie ołtarza do kościoła w Żejtun.

Kościół pozostał opuszczony do 1683. W tymże roku został odbudowany z inizjatywy Patrizju Rumana i Gregorio Bonici dei Marchesi Bordino, co 20 kwietnia 1683, a następnie 12 stycznia 1684 zostało potwierdzone przez, odpowiednio, notariusza Pietro Attarda oraz kurię. na tę okazję została również wmurowana tablica z odpowiednią inskrypcją. Odnowiony kościół został ponownie poświęcony 22 kwietnia 1683 przez proboszcza parafii Żejtun, ks. Ugolino Bonniciego.

thumb|left|180px|Reduta św. Jerzego; w głębi widoczny kościółW latach 1714–16, na terenie zajmowanym dotychczas przez cmentarz przylegający do kościoła, Zakon Maltański zbudował redutę..

Pod koniec XIX wieku świątynia została znów opuszczona;