Terytorium parku narodowego to niezwykle zróżnicowana sieć siedlisk zwierząt, które w większości pozostawały praktycznie nietknięte przez działalność człowieka, przez co zachowano zróżnicowane i całkowicie naturalne zbiorowiska zwierząt. Fauna reprezentowana jest przez 48 gatunków ssaków, 99 gatunków ptaków, 20 gatunków gadów i płazów i 5 gatunków ryb, a także 2934 gatunków bezkręgowców, z których 282 to gatunki endemiczne. Całkowita liczba trzynastu gatunków bezkręgowców jest zagrożonych wyginięciem w skali globalnej. 158 gatunków zwierząt jest pod ochroną Konwencji o ochronie gatunków dzikiej flory i fauny europejskiej oraz ich siedlisk a 24 gatunki kręgowców znajdują się w Czerwonej księdze gatunków zagrożonych. Wśród zwierząt występują tu między innymi kozica, głuszec zwyczajny, jarząbek zwyczajny, góropatwa skalna, włochatka zwyczajna, sóweczka zwyczajna, kuna leśna, suseł moręgowany, niedźwiedź brunatny zwyczajny, wilk eurazjatycki, a także jelenie, orły i sokoły.
Administracja parku znajduje się w mieście Błagojewgrad, filie zaś w miejscowościach: Samokow, Razłog, Bełowo, Borowec, Dupnica, Kostenec i Jakoruda.