Jonathan Robert Papelbon (ur. 23 listopada 1980) – amerykański baseballista, który występował na pozycji miotacza (relief pitchera).
College Papelbon studiował na Mississippi State University, gdzie w latach 2001–2003 grał w drużynie uniwersyteckiej Mississippi State Bulldogs. W ciągu trzech lat występów jako closer zanotował bilans W-L 9–6, uzyskał wskaźnik ERA 2,89 i zaliczył 13 save'ów. W czerwcu 2002 został wybrany w 40. rundzie draftu przez Oakland Athletics, jednak nie podpisał kontraktu z organizacją tego klubu.
Major League Baseball Boston Red Sox thumb|Jonathan Papelbon jako zawodnik Boston Red Sox. Po ukończeniu studiów, w czerwcu 2003 został wybrany w czwartej rundzie draftu przez Boston Red Sox i początkowo grał w klubach farmerskich tego zespołu, między innymi w Pawtucket Red Sox, reprezentującym poziom Triple-A. W Major League Baseball zadebiutował 23 lipca 2005 w meczu przeciwko Minnesota Twins jako starter. 12 września 2005 w spotkaniu z Tampa Bay Rays zanotował pierwsze zwycięstwo w MLB.