Zachowując nadal układ trzy-oddziałowy nowa struktura organizacyjna jasno różnicuje działalność „produkcyjną” od administracyjno-biurowej.
Oddział Rozwoju Doktryn (Concept and Doctrin Development – CD) – działalność “produkcyjna”; Oddział Szkolenia i Analiz (Training and Analysis – TA) – działalność “produkcyjna”; Oddział Administracyjny i Współpracy (Staff Operations and External Relations – SE) – działalność administracyjno- biurowa.
Sekcje: informatyczna i administracyjna zostały aktualnie scalone w jeden Oddział Administracyjny i Współpracy, podczas gdy Sekcja Finansowa jest nadal bezpośrednio podległa Zastępcy Dyrektora (Executive Director).
Zakres działania COE CSW rozpoczyna swoją działalność zwykle po otrzymaniu wniosku o wsparcie (RfS) wysłanego przez dowolne dowództwo (jednostkę) NATO lub państwo członkowskie. Roczny Plan Pracy (Programme of Work) zawiera szereg różnorodnych projektów, które charakteryzuje zdefiniowany oczekiwany rezultat i produkt końcowy, klient oraz data zakończenia projektu. Dodatkowym obszarem działalności są procesy (Activities), które związane są ze stałym zaangażowaniem personelu COE CSW w celu wsparcia działań transformacyjnych NATO.