jeszcze w tym samym roku dotarł do finału krajowego pucharu – Copa Argentina, przegrywając w nim jednak z Boca Juniors (1:2), natomiast w lidze uplasował się najpierw na piątej, a następnie na szóstej lokacie. W funkcji trenera Racingu został zwolniony w sierpniu 2013 po kiepskim starcie sezonu w wykonaniu jego podopiecznych. Trzy miesiące później ponownie wyjechał do Ekwadoru, gdzie tym razem w miejsce swojego rodaka Edgardo Bauzy objął stołeczny LDU Quito. Po średnio udanym pierwszym sezonie, w 2015 roku triumfował w wiosennej fazie Primera Etapa, zaś w przekroju całych rozgrywek wywalczył tytuł wicemistrza kraju, ulegając w decydującym dwumeczu Emelecowi (1:3, 0:0). Ogółem szkoleniowcem LDU pozostawał przez dwa lata, po czym zrezygnował ze stanowiska trenera w obliczu oferty z Meksyku.

W grudniu 2015 Zubeldía objął meksykańską ekipę Santos Laguna z siedzibą w Torreón. Prowadził ją bez poważniejszych osiągnięć przez osiem miesięcy;