30 lipca 2016 (sobota) W przedostatnim dniu wizyty papież nawiedził kaplicę św. Siostry Faustyny, oddając hołd relikwiom świętej. Następnie w Sanktuarium Bożego Miłosierdzia w Krakowie przemówił do pielgrzymów, przekroczył Bramę Miłosierdzia i uczestniczył w obrzędzie pojednania, podczas którego wyspowiadał grupę młodych ludzi. Kolejnym punktem wizyty była msza święta w Sanktuarium św. Jana Pawła II, odprawiona z udziałem duchowieństwa i osób konsekrowanych. W homilii ojciec święty zachęcał do służby i dyspozycyjności, przestrzegając przed pokusą wygody i zamknięcia się w swoich środowiskach.
W ramach nieplanowanych punktów wizyty papież spotkał się w pałacu z jezuitami, a następnie udał się do kościoła św. Franciszka z Asyżu, gdzie modlił się przy relikwiach polskich męczenników z Peru: Michała Tomaszka i Zbigniewa Strzałkowskiego. Dzień zwieńczyło czuwanie modlitewne z młodzieżą w Brzegach (Kampus Miłosierdzia). W przemówieniu skierowanym do rzeszy wiernych papież podkreślił, że wojna i cierpienie mają konkretne oblicza, których nie można ignorować.