11 lipca 2016 Rzecznik Praw Obywatelskich Adam Bodnar zaskarżył ustawę do Trybunału Konstytucyjnego podnosząc, że jest ona sprzeczna z Konstytucją RP, Kartą praw podstawowych Unii Europejskiej oraz Europejską konwencją praw człowieka.
Generalny Inspektor Ochrony Danych Osobowych (GIODO)
Generalny Inspektor Ochrony Danych Osobowych w opinii do rządowego projektu ustawy zwrócił uwagę na kwestię braku zapewnienia zewnętrznej kontroli przetwarzania zgromadzonych danych przez ABW. Zdaniem GIODO taka kontrola danych ABW powinna być sprawowana przez niezależny, autonomiczny organ (istniejący lub nowo powołany).
Fundacja Panoptykon
Według Fundacji Panoptykon ustawa niepotrzebnie zwiększa uprawnienia służb specjalnych i organów ścigania. Zdaniem tej organizacji niebezpieczeństwo nadużyć stwarza sytuacja, gdy szef Agencji Bezpieczeństwa Wewnętrznego może, zgodnie z ustawą, bez zgody sądu decydować o założeniu podsłuchu, zainstalowaniu ukrytej kamery czy prześwietlaniu korespondencji mailowej. Fundacja podważa też m.in.