rezultatem jego pracy w paryskim muzeum było sześć części Review of the Birds collected by Alcide d’Orbigny in South America. W 1908 wrócił do Monachium, gdzie pozostał aż do sierpnia 1922. Podjął się tam zadania utworzenia kolekcji i biblioteki ornitologicznej. Został sekretarzem generalnym Ornithological Society of Bavaria i redaktorem Verhandlungen, jego wydawnictwa; utrzymał posadę do 1921. Jednocześnie, od 1908 do 1915 zajmował się przygotowywaniem ornitologicznej sekcji bibliografii Archiv für Naturgeschichte.
W 1922, rok po śmierci Charlesa Barneya Cory’ego, Carl Hellmayr wyjechał do Chicago, gdzie został kuratorem sekcji ptaków w tamtejszym Muzeum Historii Naturalnej. Cory pozostawił po sobie jeden tom (w 2 częściach) Catalogue of birds of the Americas and the adjacent islands in Field Museum of Natural History. Hellmayr do Chicago dotarł 1 października 1922. Opracował 13 spośród 15 tomów Catalogue.... Do Europy wrócił w czerwcu 1931. Dzieło to było szczególnie ważne ze względu na panujący pod koniec XIX i na początku XX wieku chaos w nazewnictwie i systematyce ptaków neotropikalnych. Dwoma znamienitymi ornitologami zajmującymi się tymi ptakami byli Władysław Taczanowski i Hans von Berlepsch.