Szkoła Myślenia (2008/2009 i 2009/2010) Zadaniem było rozwijanie precyzyjnego, krytycznego i naukowego myślenia, a także prowadzenie badań, zarówno matematyczno-przyrodniczych, jak humanistyczno-społecznych. Szczególnie ważne były szkolne festiwale nauki.
Szkoła z Klasą 2.0 (od 2010/2011) Szkoła z Klasą zyskała w 2010 roku dopisek „2.0”. Organizatorzy wspierają szkoły w mądrym korzystaniu z technologii informacyjno-komunikacyjnych (TIK).
W roku 2010/2011 ponad 100 szkół objęto specjalnym programem Laboratorium 2.0, nauczyciele wraz z uczniami wypracowywali tzw. Kodeksy 2.0 – zasady korzystania z nowych technologii w nauczaniu i szkolnej komunikacji oraz pracowali z metodą projektu.
W 2011/2012 każda z 500 szkół-uczestniczek doskonalących wykorzystanie TIK dostała router, a 30 szkół zostało objętych „Pilotażem 2.0”. W ramach niego nauczyciele testowali różne sposoby wykorzystania sprzętu komputerowego na lekcjach oraz nowe metody nauczania, m.in. odwróconą lekcję.
W 2012/2013 w programie pojawiły się „Wirtualne pracownie 2.0” prowadzone przez znanych specjalistów.