Francesco Bottigliero występował gościnnie z takim orkiestrami jak: Narodowa Orkiestra Filharmonii w Sybinie, Orkiestra Symfoniczna w Kiszyniowie, Orkiestra Kameralna im. Janáčka w Ostrawie, Orkiestra Symfoniczna „San Pietro a Majella” złożona z wykładowców Konserwatorium w Neapolu, Orkiestra Smyczkowa „I Musici di Adelperga” w Salerno oraz „Camerata Romanica” w Neapolu, jak również Orkiestra „Compagnia Italiana di operetta” w Mediolanie oraz „St. Petersburg Congress Orchestra” w Sankt Petersburgu.
Na stałe współpracował z Operą Hamburgische Staatsoper, Operą Wrocławską, Operą Bałtycką, Teatrem Wielkim w Poznaniu oraz Theater Erfurt. Dyrygował Rigoletto G. Verdiego i Wesele Figara W.A. Mozarta w Operze Wrocławskiej, Don Pasquale G. Donizzetiego, Kandyda L. Bernsteina, Maddalenę S. Prokofjewa, La serva padrona G.B. Pergolesiego w Teatrze Wielkim w Poznaniu, Wesele Figara W.A. Mozarta w Operze Bałtyckiej w Gdańsku, Madamę Butterfly G. Pucciniego oraz Carmen G. Bizeta w Operze Śląskiej w Bytomiu, Napój miłosny G. Donizettiego i Toscę G. Pucciniego w Slezske Divadlo w Opawie.