Odbiór Gra została pozytywnie odebrana. Szczególnie chwalono jej prostotę, mechanikę i element współzawodnictwa. Stała się sławna w serwisie YouTube. Krytyka dotyczyła głównie powtarzalności i sterowania w wersji mobilnej. Tom Christiansen z Gamezebo miał do gry mieszane uczucia, twierdząc, że nie było w niej nic, co mogłoby utrzymać jego uwagę i że „zasadniczo była monotonna".
Gra osiągnęła szybki sukces dzięki mediom społecznościowym i transmisjom na Twitchu i YouTube. Alexa Internet oznaczył Agar.io jako jedną z 1000 najczęściej odwiedzanych stron internetowych„agar.io Site Overview”., a w wersji mobilnej został pobrany ponad dziesięć milionów razy w ciągu pierwszego tygodnia od wydania. W 2015 roku serwis Trendy Google umieścił grę na liście najczęściej wyszukiwanych stron internetowych. W 2015 Agar.io było piątą najpopularniejszą grą na serwisie Youtube.
Agar.io został pokazany w „Rozdziale 48" serialu House of Cards.