W 1884 roku cesarz austriacki Franciszek Józef I nadał mu tytuł szlachecki.
Zmarł wskutek cukrzycy 18 lipca 1884 roku w Oberdöbling koło Wiednia.
Członkostwa 1862 – Bawarska Akademia Nauk 1862 – Niemiecka Akademia Przyrodników Leopoldina 1869 – American Philosophical Society
Publikacje Von Hochstetter opublikował ponad 150 prac naukowych, m.in.: Neu-Seeland, 1863 Reise der österreichischen Fregatte Novara um die Erde, 3 tomy, 1864–1866 Leitfaden der Mineralogie und Geologie, 1876 (razem z A. Bischingiem) Das Hof-Mineraliencabinet in Wien [...], 1884
Upamiętnienie Na cześć von Hochstettera nazwano wiele gatunków roślin i zwierząt odkrytych w Nowej Zelandii, m.in. gatunek grzybów z rodziny dzwonkówkowatych o charakterystycznej niebieskiej barwie – Entoloma hochstetteri, gatunek żaby – Leiopelma hochstetteri czy gatunek mięsożernego ślimaka – Powelliphanta hochstetteri.
Wiele obiektów geograficznych na terenie Nowej Zelandii nosi nazwę upamiętniająca von Hochstettera m.in. dwie góry – Mt.