Jaskinia powstała w szaroniebieskich (do ciemnoszarych) wapieniach środkowego triasu, tzw. guttensteinskich, biało żyłkowanych żyłkami kalcytu, zaliczanych do płaszczowiny choczańskiej. Pomimo znacznej sumarycznej długości korytarzy zajmuje jedynie niewielki obszar w kształcie prostokąta o wymiarach 100 x 120 m. Przedstawia rozbudowany labirynt korytarzy usytuowanych na czterech głównych poziomach, usytuowanych jeden nad drugim i połączonych ze sobą licznymi studniami i ukośnymi tunelami. Wynika to stąd, że cały system jaskiniowy został utworzony przez boczne ramię Wagu, który w okresie czwartorzędu wieloma etapami wcinał się w podłoże, tworząc kolejne piętra jaskini odpowiadające terasom rzecznym. Największymi komorami jaskini są Veľká sieň o długości 75 m i największym przekroju 10x10 m (objętość ok. 5600 m³) oraz Jánošíkova sieň o długości 40 m i maksymalnym przekroju 10x10 m (objętość ok. 1000 m³).