23 czerwca 2012 roku odbył się finał przesłuchania drugiej generacji, w którym wybrano 34 z 48 finalistek. 18 sierpnia zarząd ogłosił, że pięć członkiń, 3 z Team H (Komori, Sugamoto i Taniguchi) oraz 2 z Kenkyūsei (Etō i A. Nakanishi) odchodzą z HKT48 „z powodów osobistych”. 24 sierpnia, podczas pierwszego dnia koncertu AKB48 w Tokyo Dome ogłoszono, że Aika Ōta z Team A zostanie przeniesiona do HKT48. 23 września 2012 ogłoszono skład drugiej generacji HKT48.
Debiutancki singel HKT48, Suki! Suki! Skip! ukazał się 20 marca 2013 roku pod wytwórnią Universal Sigma.
31 marca 2016 roku teatr w Hawks Town Mall został zamknięty, ze specjalnym pożegnalnym występem. Nowy teatr został otwarty w Nishitetsu Hall 28 kwietnia 2016 roku.
Członkinie Z dniem 16 lutego 2022 grupa składała się z 45 członkiń podzielonych na kilka zespołów: Team H z 15 członkami, Team KIV z 14 członkami, Team TII z 16 członkami. Członkinie są osobną grupą dziewczyn, które nie zostały awansowane do oficjalnych zespołów, z wyjątkiem członków projektu. to członkinie wybrane przez publiczne przesłuchanie, w którym liczba wstępnie wybranych kandydatek miała szansę zostać wcielonych do zespołu przez grupę przedstawicielek zespołów.
Zespoły: Team H, Team KIV, Team TII, Kenkyūsei.
Team H Natsumi Matsuoka jest kapitanem Team H.