Siatka połączeń szybko rozrosła się na całe Niemcy i zaczęła wykraczać poza granice kraju. Nawiązano także współpracę z austriackim przewoźnikiem kolejowym i autobusowym Westbahn. W 2014 roku FlixBus przewiózł 3,5 mln pasażerów, co dało mu 2. wynik w kraju (po przewoźniku MeinFernbus z wynikiem 7,2 mln pasażerów). Od 2014 roku wyszukiwanie połączeń FlixBus jest możliwe za pomocą Map Google
W roku 2015 nastąpiła ekspansja na kraje sąsiednie, powstały spółki-córki m.in. we Francji, w Holandii, w Danii oraz w Austrii. Doszło do fuzji z przedsiębiorstwem oferującym przewozy pod marką MeinFernbus. Obie spółki działały początkowo pod marką MeinFernbus FlixBus, nazwa MeinFernbus była jednak stopniowo zastępowana marką FlixBus. Nowe barwy firmy to zapożyczona z MeinFernbus zieleń oraz pomarańcz. W 2015 roku do przedsiębiorstwa należało 71% rynku dalekobieżnych połączeń autobusowych w Niemczech. W 2015 roku doszło także do przejęcia przedsiębiorstwa Liniita.
W grudniu 2015 roku FlixBus nawiązał współpracę z firmą Interglobus ze Szczecina, która uruchamiała autokary pod marką Follow Me!