Od 2018 roku, wspólnie z Polską Radą Biznesu, Fundacja przyznaje również Nagrodę im. Andrzeja Czerneckiego za wyróżniającą się działalność społeczną i filantropijną dla osób i organizacji ze środowiska biznesu.
W 2022 roku Fundacja uruchomiła program Philanthropy for Impact we współpracy z międzynarodową organizacją Ashoka, mający na celu wspieranie innowacyjnych działań filantropijnych i zachęcanie do aktywności filantropijnej przedsiębiorstw i osób w regionie Europy Środkowej i Wschodniej.
Od 2021 roku Fundacja współpracuje z Muzeum Sztuki Nowoczesnej w Warszawie przy programie "Formy podstawowe", dostarczając uczniom w całej Polsce dzieła sztuki i narzędzia, przygotowane przez artystów z całego świata. Uczniowie doświadczają i tworzą sztukę współczesną, formując nawyk uważnego obserwowania świata i jego kreatywnego kształtowania. Za to działanie w 2024 roku Edukacyjna Fundacja Czerneckiego została nagrodzona Doroczną Nagrodą Ministra Kultury i Dziedzictwa Narodowego w kategorii Mecenas Kultury.