Z końcem 2014 roku struktura ukraińskich wojsk obrony terytorialnej uległa poważnym przeobrażeniom. Istniejące dotąd bataliony obrony terytorialnej przekształcone zostały w bataliony piechoty zmotoryzowanej, zachowały swoje miana i włączone zostały w skład brygad Wojsk Lądowych. Za organizację obrony terytorialnej odpowiada Sztab Generalny Sił Zbrojnych Ukrainy. Bezpośredni nadzór nad obroną terytorialną sprawuje dowódca Sił Zbrojnych Ukrainy. W ramach swoich kompetencji zadania obrony terytorialnej wykonują Siły Zbrojne, inne formacje wojskowe utworzone w oparciu o ukraińskie prawo, organy spraw wewnętrznych, jednostki Państwowej Specjalnej Służby Transportu, jednostki Państwowej Specjalnej Służby Łączności oraz inne uprawnione organy ścigania.
Komisariaty wojskowe, przypisane do poszczególnych obwodów, tworzą samodzielne bataliony strzeleckie, a rejonowe (lub miejskie) komisariaty wojskowe tworzą w zależności od zapotrzebowania od dwóch do pięciu jednostek obrony (zwanych zagonami, odpowiadających wielkością i strukturą kompaniom).