Wernicke i Lutsch widzieli na tarczach przy scenie Zwiastowania datę 1521, a nie jak obecnie 1525. Nie zachował się baldachim predelli, a także niektóre atrybuty figur w kwaterach wewnętrznych awersów. W październiku 1990 r. skradziono cztery figury z predelli - popiersia świętych. Ołtarz był odnawiany w 1895 r. a w 1966 r. zabezpieczany przez konserwatora Stanisława Filipiaka.
Stan zachowania sprzed 2013 r. thumb|330px|left|Ołtarz sprzed konserwacji Stan zachowania ołtarza był zły. Silnie zabrudzony i zakurzony posiadał liczne spękania, spęcherzenia i wykruszenia warstwy zaprawy. Wadliwy montaż pentaptyku uniemożliwiał otwarcie skrzydeł bocznych, a tym samym prezentację wszystkich malowanych scen ołtarza. Konstrukcja poszczególnych części pentaptyku wymagała wzmocnienia – drewno impregnacji. Na całej powierzchni, a zwłaszcza w dolnych partiach, a także grawerowanych obramieniach skrzydeł i w obrębie rzeźbionych i płaskorzeźbionych postaci występowały ubytki warstwy gruntów, złoceń i warstwy malarskiej. Częściowo były to ubytki wypełnione kitem woskowym i podbarwione (w partiach złoceń na kolor ugrowy) podczas poprzedniej konserwacji. Sposób wypełnienia ubytków, ich zakres oraz zastosowane materiały zakłócały odbiór dzieła i znacznie odbiegały od pierwotnej formy i kolorystyki.