W 1983 po przeszło 22 latach służby dysponował nalotem wynoszącym powyżej 10 tys. godzin, pilotując nierzadko w ciężkich warunkach atmosferycznych oraz docierając i lądując w rejonach trudno dostępnych. W całym 1985 roku śmigłowiec sanockiego ZLS wykonał 416 lotów. Podczas obchodów Święta Lotnictwa Polskiego w Rzeszowie-Jasionce Mendyka uczestniczył w pokazach lotniczych, pilotując Mi-2. W 1987 odszedł na emeryturę.
W Sanoku Jerzy Mendyka założył rodzinę. Był żonaty, miał dzieci. Zmarł 21 listopada 1997 w Sanoku. Został pochowany na cmentarzu komunalnym w Sanoku 25 listopada 1997, a dla uczczenia pilota podczas uroczystości pogrzebowych nad nekropolię wzleciał śmigłowiec Mi-2.
Odznaczenia i wyróżnienia Złoty Krzyż Zasługi. Medal 30-lecia Polski Ludowej (1975). Odznaka Honorowa za Zasługi dla Ratownictwa Górskiego. odznaczenia regionalne. Laureat konkursu-plebiscytu „Postawy”, organizowanego przez dziennik „Nowiny” i rozgłośnię Polskiego Radia w Rzeszowie (1973). Wyróżnienie „Błękitne Skrzydła” przyznane przez czytelników „Skrzydlatej Polski” (1987, za śmigłowcowe loty w Bieszczadach, a zwłaszcza za akcję ratowniczą celem uwolnienia trzech turystów otoczonych przez wezbrane wody Sanu w okolicach Sękowca)Według Andrzeja Olejki wyróżnienie „Błękitne Skrzydła” zostało przyznane Jerzemu Mendyce w 1974.