Dwie znaczące, niedatowane (przypuszczalnie z późnych lat 1750.) prace Favraya z okresu pierwszego pobytu na Malcie to Wielki Mistrz Philippe Villiers de L’Isle Adam przejmujący Mdinę oraz Wielki Mistrz Jean de Valette. Z tego okresu pochodzą również jego inne znamienite dzieła, żeby wymienić tylko Portret baliwa Johanna von Schauwenburg, Portret rycerza, Siostry Mirabita, Portret damy (niebieski) czy Portret biskupa Alpherana.
thumb|left|180px|Obraz Święty Katald w kościele tego wezwania w Rabacie W 1760 namalował ostatni monumentalny obraz o tematyce religijnej, był to Święty Katald w kościele pod wezwaniem tego świętego w Rabacie.
Favray namalował również szereg obrazów sztalugowych o charakterze religijnym, w tym Święci Paweł i Jan Chrzciciel (Muzeum Wignacourta w Rabacie), na rynek prywatny. Trzy z najwspanialszych to Odpoczynek w czasie ucieczki do Egiptu (kolekcja prywatna, Malta) oraz historyczne krajobrazy Św. Franciszek z Asyżu otrzymujący stygmaty (Muzeum Sztuk Pięknych, Valletta) i Ecce Agnus Dei (kolekcja prywatna, Malta).
Favray był zapalonym i chętnym rysownikiem, używał ołówka i papieru znacznie częściej niż jakikolwiek inny artysta działający na Malcie w tym okresie.