Po prawej stronie, znajdują się jeszcze inne, mniejsze organy, dzieło Serassiego, budowniczego organów z Bergamo.

Wnętrze thumb|240px|Nawa z przylegającymi do niej kaplicami Kaplice Wnętrze bazyliki stanowi jedyna nawa, do której przylega sześć kaplic: kaplicę Dobrej Śmierci (cappella della Buona Morte), pierwszą po prawej stronie, zdobią freski pędzla Morazzone i obraz Moncalva, kaplicę Obrzezania (capella della Circoncisione), drugą po prawej stronie, wypełnia płótno Fiammenghino, w kaplicy Krucyfiksu (cappella del Crocifisso), trzeciej po prawej stronie, dominuje krucyfiks, przypisywany Gaudenziowi Ferrariemu, kaplicę Anioła Stróża (cappella dell'Angelo Custode), pierwszą po lewej stronie, zdobią freski Tanzia da Varallo z 1629 roku, przedstawiające: świętych patronów rodu Nazari, sceny biblijne oraz Raj i Czyściec. Inspiracją do powstania tych fresków, jak również obrazu Bitwa Sennacheryba, była przypuszczalnie sztuka Europy Środkowej;