W przypadku rzek oznacza to, że monitorowane mają być następujące kategorie elementów hydromorfologiczne z przykładowymi elementami: geometria koryta zarys roztoki krętość rzeki przekształcenia zarysu podłoże koryta sztuczne typy podłoży naturalne typy podłoży zagospodarowanie zlewni (np. mające wpływ na zamulenie) roślinność koryta i organiczne szczątki formy życiowe roślin wodnych szczątki liści i drewna zabiegi dotyczące roślinności wykaszanie erozja i charakter depozycji cechy w korycie łącznie z podstawą brzegu odsypiska ławice i wyspy podcięcia brzegu przepływ rzeki model przepływu przepływ swobodny, woda marszcząca się lub gładka wpływ ostróg, deflektorów cechy przepływu plosa bystrza reżim odpływu odprowadzanie wody przerzuty zasilanie zrzuty z zapór wpływ sztucznych struktur na podłużną ciągłość sztuczne bariery ograniczające ciągłość przepływu, transport rumowiska i migrację organizmów jazy zapory śluzy przepusty struktura i modyfikacje brzegu materiał budujący brzeg typy umocnień taras zalewowy typ użytkowania terenu z zasięgiem zagospodarowania rodzaje otwartych wód i terenu podmokłego starorzecza torfowiska stawy rybne kanały żwirownie stopień bocznej łączności rzeki z tarasem zalewowym, możliwość zmiany położenia koryta rzecznego ograniczenia potencjalnej