Pomimo tych niewątpliwych zasług Klarysa nie była popularna we Florencji, ponieważ jej głęboko religijna osobowość pozostawała w wyraźnym kontraście z humanistycznymi ideami epoki. Nawet sam Wawrzyniec preferował Florentynkę Lukrecję Donati, której dedykował swoje wierszePaul Strathern: 'Medyceusze. Mecenasi sztuki – tyrani – kochankowie str. 158.. Z dziesięciorga dzieci pary jedynie troje nie przeżyło dzieciństwaPaul Strathern: 'Medyceusze. Mecenasi sztuki – tyrani – kochankowie str. 160..
Podczas zawiązanego z inspiracji samego papieża Spisku Pazzich, którego celem miało być zamordowanie Wawrzyńca i jego młodszego brata Juliana, a w konsekwencji załamanie finansowej potęgi rodu Medyceuszy oraz ich panowania we Florencji, Klarysa wraz z dziećmi została wysłana do Pistoi. (Pazzim powiodła się próba zamordowania Juliana, ale Wawrzyniec przeżył zamach, przez co plan spiskowców zakończył się klęskąPaul Strathern: Medyceusze. Mecenasi sztuki – tyrani – kochankowie str. 166-167..)