CXorf49 je protein koji je kod ljudi kodiran genom otvorenog okvira čitanja 49 (CXorf49), na hromosomu X.
Gen Gen CXorf49 ima dvojnika CXorf49B lokusa. Preimenovanje A8MYA2 se također odnosi na protein kodiran sa CXorf49 ili CXorf49B.
CXorf49 dug je 3.912 baznih parova, sa šest egzona. CXorf49 ima jedan transkript za kodiranje proteina.
Protein Protein ima 514 aminokiselina i molekulsku masu od 54,4 kDa. Izoelektrična tačka je 9,3. U poređenju sa drugim ljudskim proteinima, CXorf49 je glicin– i prolin-bogat, ali ima niže nivoe asparagina, izoleucina, tirozina i treonina (Statistička analiza proteinskih sekvenci, SAPS ).
Domeni thumb|472x472px|Protein sa domenom nepoznate funkcije. Domen nepoznate funkcije, DUF4641, gotovo je u cjelosti protein. Dug je 433 aminokiseline, od aminokiseline 80 do aminokiseline broj 512. DUF4641 is a part of pfam15483. Domen je bogat prolinom i argininom, ali DUF4641 ima niže razine izoleucina, tirozina i treonina u odnosu na druge ljudske proteine (Analiza proteinskih sekvenci, SAPS. DUF4641 ima neobičan razmak između lizinskih ostataka i pozitivno nabijenih aminokiselina (Analiza proteinskih sekvenci, SAPS).
Post-translacijske modifikacije Predviđa se da će CXorf49 imati nekoliko post-translacijskih mjesta. To uključuje lokacije za N-acetiltransferazu (NetAcet 1-), glikacija ε amino grupa lizina (NetGlycate 1.0), mucinski tip GalNAc O-glikozilacije (NetOglyc 4.0), phosphorylation (NetPhos 2.0), sumoilacija (SUMOplot program za analizu) i O-ß-GlcNAc dodatak (YinOYang WWW).
Subćelijska lokalizacija Predviđa se da se protein CXorf49 nalazi u ćelijskom jedru (PSORT II http://psort.hgc.jp/cgi-bin/runpsort.pl|date=July 2017 |bot=InternetArchiveBot |fix-attempted=yes }}).
Ekspresija
Promotorska regija Regija promotora CXorf49 nalazi se između baznog para 71718051 i 71718785 na minus lancu X hromosoma i duga je 735 bp (Genomatixov ElDorado program ). Jedan od najčešćih transkripcijskih faktora mjesta vezanja u promotorskoj regiji su mjesta za faktor vezanja za Y-boks.).
Interakcije Još uvijek nije dokazano da li protein CXorf49 stupa u interakciju s drugim proteinima (PSICQUIC).
Utvrđeno je da je CXorf49 jedna od komponenata male grupe HL-60 ćelijskih proteoma koja je bila najsklonija stvaranju adukata 4-hidroksi-2-nonenala (HNE), nakon izlaganja netoksičnim (10 μM) koncentracijama HNE, zajedno sa toplotnim šokom 60 kDa proteina 1.
Homologija Upotrebom BLAST-aProtein BLAST nađeno je da nema ortologa za CXorf49 u jednoćelijskim organizmima, gljivama ili biljkama čiji su genomi sekvencirani. Za višećelijske organizme ortolozi se nalaze kod sisara. Tabela ispod prikazuje izbor ortologa sisara. Navedeni su nakon vremena evolucijskog razdvajanja od ljudi. Rod i vrstaUobičajeno imePristupni broj Dužina sekvencePoklapanje sa ljudskim proteinomPan troglodytesČimpanzaXP_001137982514 aa98 %Callithrix jacchusObični marmozetXP_008987719487 aa65 %Galeopterus variegatusMalajski leteći lemurXP_008574823525 aa54 %Tupaia chinensisKineska verirovkaXP_006168003527 aa35 %Chinchilla lanigeraDugorepa činčilaXP_013358263307 aa49 %Mus musculusKućni mišNP_081944513 aa36 %Canis lupus familiarisPasXP_850392526 aa54 %Odobenus rosmarus divergensPacifički moržXP_012422579530 aa51 %Mustela putorius furoFeretXP_004777306544 aa50 %Lipotes vexilliferKineski riječni delfinXP_007452050529 aa45 %Ovis areisOvcaXP_004022229536 aa45 %Capra hircusKozaXP_005700711538 aa44 %Myotis lucifugusMali smeđi šišmišXP_006083036500 aa42 %Myotis davidiiDavidov miotisXP_006759573495 aa42 %Bos taurusGovedoNP_001092664534 aa42 %Equus asinusMagaracXP_014707878723 aa42 %Trichechus manatus latirostris Floridska morska kravaXP_012415455505 aa44 %Dasypus novemcinctusDevetoprugasti armadiloXP_004475873497 aa44 %Orycteropus afer aferJužnoafrički mravojedXP_007957133477 aa38 %
Filogenija CXorf49 se razvio od mravojedskog, do ljudskog proteina tokom 105,0 miliona godina.
Reference
Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu X Kategorija:Citogenetika